20年代末，为完成师父的志愿，陈真（李连杰 饰）到东洋学先进技术，他喜欢着日本女孩山田光子（中山忍 饰）。因为师父霍元甲之死，陈真回到中国，协助师父之子霍廷恩（钱小豪 饰）主持精武门的业务，不料却引起了他的妒忌，师兄弟之间引发权力之争。另一方面，陈真追查师父死因，怀疑是日军 军官藤田刚（周比利 饰）暗中使用慢性毒药杀死霍元甲。陈真请医生验尸，证实师父确系中毒而死。藤田刚恐阴谋败露，杀人嫁祸，展开了连场恶斗。不久，藤田刚挑战精武门，他诱使日本黑龙会总教头船越文夫向精武馆挑战。比武之日，双方开展了一场惊心动魄的决战。

社工杨颖琦为一群任性少女开设的“深宵体育馆”项目面临被取消资金的威胁，为了挽救于是她将她们组建为一支闪避球球队。而在一位失业的前明星运动员教练帮助下，少女们了解到，逃避问题可以暂时奏效，但她们必须学会最终站起来克服挑战。

影片剧情继续围绕失忆后的时矢展开。某日，时矢和佐相路过人气小说家的签售会，而小说家嵯峨恰巧是时矢大学时代的恋人。与此同时，某经济评论家被发现死亡。但奇怪的是，在尸体的口中发现了一张纸，纸上写有 “第一凶手是河上彦斋 ”的字样。河上彦斋是江户末期在京都进行刺杀活动的四名武士组成的 “幕末四大刽子手”之一。几天后，类似的案件再次发生，死者口中仍然发现了手写纸条。调查案件之时，时矢的脑海中经常出现自己身为侦探的画面，而在死者口中发现的纸条，也被证实字迹与时矢完全一致。更加匪夷所思的是，连环杀人案的一切居然与时矢大学时所写的侦探小说一模一样，时矢在查案的同时也开始寻找自己丢失的记忆。

故事发生在福建海口镇，林同善（于海 饰）和陈亚珍均生长于武术之家，两家人的关系因此十分淡漠。某日，侵华倭寇绑架了陈亚珍的孩子小毛头，此事恰巧被一位名叫上地完雄（于荣光 饰）的年轻武士撞见，上地完雄来中国，希望能够在这里磨炼技艺，正义感爆棚的他救下了小毛头，却在一场意外中含冤背负了杀人的罪名，只有小毛头一人知晓上地完雄的清白。在南少林寺尚智大师的调解之下，林、陈两家放下恩怨，冰释前嫌。此时正值妈祖节，街道上涌动着游行欢庆的队列。在一片欢乐祥和的气氛下，日本人川岛和矢村正在酝酿着他们的阴谋，他们妄图盗取妈祖像上价值连城的夜明珠。