相传古巴比伦毁灭之前，神明将全城的黄金集于一处，可如此巨大的一笔财富却在城破之后消失的无影无踪。几千年后的纽约街头，一个醉醺醺皱巴巴的老太婆，哼着一支关于巴比伦的歌谣来找鲁邦……本作为鲁邦三世剧场版第三部，于1985年7月13日上映。

20世纪50年代末的南海沙滩上，社会主义的汹涌热潮在这里也呈现出红红火火的场面。少年们偶然在沙子中挖出了一顶日军钢盔，由此将公社书记廖阿彩（吴文华 饰）的记忆带回了硝烟弥漫的战争时期。1937年，楚楚动人的阿彩和自小认识的玩伴金喜互有好感，却始终不能吐露心声。与此同时，渔霸高仁利（陈天纵 饰）及其儿子高子端（详仪元 饰）则百般刁难这群苦难之人。金喜被逼还债，阿彩则面临给高仁利当小老婆的厄运。在工人赤卫队队员张伯（蒋锐 饰）的协助下，二人排除万难，终于喜结连理。随着七七事变的爆发，整个中华民族的命运都为之发生改变，阿彩和身边的人将面临前所未有的考验……

每天清晨都有一辆AE86在秋名山上漂移，而且速度快得惊人，这辆AE86属于藤原豆腐店。藤原拓海（周杰伦 饰）每天清晨都要帮父亲藤原文太（黄秋生 饰）把自家店里的豆腐送到秋名山上的旅店，但这并不是拓海想做的一件事。拓海还会在阿木（杜文泽 饰）家开的加油站做兼职。中里毅（余文乐 饰）向阿木的车队挑战，当中里毅在秋名山练习的时候，竟然被一辆AE86轻易爬过头，中里毅决定打听这辆AE86的消息，要跟他比赛一番。

第八代将军吉宗执政之时。相马藩士丹下左马之介奉命杀死自己的密友、藩内奸细神岛小十郎，事后，左马之介又遭暗算，右眼受伤、右臂被斩……一天，柳生藩受到命令，承担修复日光东照宫的任务。这实际上是将军身边的臣子愚乐老人企图吞掉柳生藩的奸计。焦急不已的藩主对马守得知家中有一个藏有黄金一百万两的宝罐，有了它定能顺利动工。而此罐在对马守的弟弟源三郎处，在护罐回藩的路上，对马守的人马遭遇愚乐手下刺客的袭击。意外知晓宝罐秘密的小偷与吉和阿藤，趁乱得手。就在这时，一名身着白衣自称是丹下左膳的独眼独臂浪人，突然现身，并和与吉、阿藤，一块带着宝罐消失了。愚乐得知后，命对马守必须带着宝罐出席五日后举行的宽永寺院大茶会。源三郎立即派人寻找宝罐。另一边，左膳带着一个假罐子，找到愚乐，并换回一百两钱。这时，左膳在还是左马之介时候的恋人萩乃，闻讯找上门来，她的出现引起了阿藤的嫉妒。于是，她带上真的宝罐，去找愚乐。左膳赶去时，与吉和阿藤被当作人质捉拿，危机关头，被源三郎救下。左膳答应源三郎，一定会赶在茶会举行当天拿回宝罐。不久，已是宽永寺院大茶会之日，左膳在与吉和阿藤的帮助下，杀出一条血路，并登上五重塔，大声戳穿了愚乐老人的计谋。大冈越前守听罢，与左膳约定，只要他离开江户，就宽恕与吉和阿藤。至此，愚乐机关算尽终自灭，柳生藩也度过了危难……左膳则大步朝着江户城外走去。